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LOOS 4.1.0
The Lightweight Object Oriented Structural analysis library/toolkit
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This is the complete list of members for loos::HBonds::SimpleAtom, including all inherited members.
| angle(const SimpleAtom &s) const (defined in loos::HBonds::SimpleAtom) | loos::HBonds::SimpleAtom | |
| attach(const loos::pAtom &a) (defined in loos::HBonds::SimpleAtom) | loos::HBonds::SimpleAtom | inline |
| attachedTo() const (defined in loos::HBonds::SimpleAtom) | loos::HBonds::SimpleAtom | inline |
| debuggingMode() (defined in loos::HBonds::SimpleAtom) | loos::HBonds::SimpleAtom | inlinestatic |
| debuggingMode(const bool b) (defined in loos::HBonds::SimpleAtom) | loos::HBonds::SimpleAtom | inlinestatic |
| distance2(const SimpleAtom &s) const (defined in loos::HBonds::SimpleAtom) | loos::HBonds::SimpleAtom | |
| findHydrogenBonds(const std::vector< SimpleAtom > &group, const bool findFirstOnly=true) (defined in loos::HBonds::SimpleAtom) | loos::HBonds::SimpleAtom | |
| findHydrogenBondsMatrix(const std::vector< SimpleAtom > &group, loos::pTraj &traj, loos::AtomicGroup &model, const uint maxt) const (defined in loos::HBonds::SimpleAtom) | loos::HBonds::SimpleAtom | |
| findHydrogenBondsMatrix(const std::vector< SimpleAtom > &group, loos::pTraj &traj, loos::AtomicGroup &model) const (defined in loos::HBonds::SimpleAtom) | loos::HBonds::SimpleAtom | inline |
| findHydrogenBondsVector(const std::vector< SimpleAtom > &group) (defined in loos::HBonds::SimpleAtom) | loos::HBonds::SimpleAtom | |
| hydrogenBond(const SimpleAtom &other) const (defined in loos::HBonds::SimpleAtom) | loos::HBonds::SimpleAtom | |
| innerRadius() (defined in loos::HBonds::SimpleAtom) | loos::HBonds::SimpleAtom | inlinestatic |
| innerRadius(const double r) (defined in loos::HBonds::SimpleAtom) | loos::HBonds::SimpleAtom | inlinestatic |
| maxDeviation() (defined in loos::HBonds::SimpleAtom) | loos::HBonds::SimpleAtom | inlinestatic |
| maxDeviation(const double d) (defined in loos::HBonds::SimpleAtom) | loos::HBonds::SimpleAtom | inlinestatic |
| operator<< (defined in loos::HBonds::SimpleAtom) | loos::HBonds::SimpleAtom | friend |
| outerRadius() (defined in loos::HBonds::SimpleAtom) | loos::HBonds::SimpleAtom | inlinestatic |
| outerRadius(const double r) (defined in loos::HBonds::SimpleAtom) | loos::HBonds::SimpleAtom | inlinestatic |
| processSelection(const std::string &selection, const loos::AtomicGroup &system, const bool use_periodicity=false) (defined in loos::HBonds::SimpleAtom) | loos::HBonds::SimpleAtom | static |
| rawAtom() const (defined in loos::HBonds::SimpleAtom) | loos::HBonds::SimpleAtom | inline |
| SimpleAtom(const loos::pAtom &a) (defined in loos::HBonds::SimpleAtom) | loos::HBonds::SimpleAtom | inline |
| SimpleAtom(const loos::pAtom &a, const loos::SharedPeriodicBox &b, const bool c=true) (defined in loos::HBonds::SimpleAtom) | loos::HBonds::SimpleAtom | inline |
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