Here is a list of all documented functions with links to the class documentation for each member:

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• accumulate() : loos::UniformWeight, loos::Weights
• actualSize() : loos::Math::SparseArray< T >
• add() : loos::DensityTools::SimpleMeta, loos::OptionsFramework::AggregateOptions, loos::Remarks, loos::UniqueStrings
• add_argument() : loos.pyloos.options.LoosOptions
• addArgument() : loos::OptionsFramework::RequiredArguments
• addBond() : loos::Atom
• addGeneric() : loos::OptionsFramework::BasicConvergence, loos::OptionsFramework::BasicWater, loos::OptionsFramework::OptionsPackage, ToolOptions
• addHidden() : loos::OptionsFramework::OptionsPackage, ToolOptions
• addPositional() : loos::OptionsFramework::OptionsPackage, ToolOptions
• addTraj() : loos::Weights, loos::WeightsFromFile
• addTrajectory() : loos::MultiTrajectory
• addVariableArguments() : loos::OptionsFramework::RequiredArguments
• AggregateOptions() : loos::OptionsFramework::AggregateOptions
• alignOnto() : loos::AtomicGroup
• alignWith() : loos.pyloos.trajectories.AlignedVirtualTrajectory
• allHaveProperty() : loos::AtomicGroup
• allRemarks() : loos::Remarks
• allSkip() : loos.pyloos.trajectories.VirtualTrajectory
• allStride() : loos.pyloos.trajectories.VirtualTrajectory
• Amber() : loos::Amber
• anyHaveProperty() : loos::AtomicGroup
• append() : loos.pyloos.trajectories.AlignedVirtualTrajectory, loos.pyloos.trajectories.VirtualTrajectory, loos::AtomicGroup
• apply() : loos::AtomicGroup
• applyTransform() : loos::AtomicGroup
• applyWithinRadius() : loos::DensityTools::DensityGrid< T >
• assignSuitenameSuites() : loos::RnaSuite
• Atom() : loos::Atom
• AtomicGroup() : loos::AtomicGroup
• atomOrderMapFrom() : loos::AtomicGroup
• autoTerminate() : loos::PDB
• average() : loos::TimeSeries< T >
• averageLapTime() : loos::Timer< TimerType >