Here is a list of all documented functions with links to the class documentation for each member:

- s -

• scale() : loos::XForm
• scattering() : loos::AtomicGroup
• scientific() : loos::Fmt
• seedLengths() : Simplex< T >
• seekFrame() : loos::Trajectory
• seekNextFrame() : loos::Trajectory
• select() : loos::AtomicGroup
• set() : loos::Coord< T >, loos::DensityTools::SimpleMeta, loos::Weights
• set_skip() : loos::TimeSeries< T >
• setBonds() : loos::Atom
• setCommentCharacter() : loos::LineReader
• setComments() : loos::DCDWriter, loos::TrajectoryWriter
• setCoords() : loos::AtomicGroup
• setExpected() : loos::EstimatingCounter
• setHeader() : loos::DCDWriter
• setLeadingCharacters() : loos::LineReader
• setMasses() : ENM::VSA
• setParams() : ENM::BoundSuperBlock, ENM::ConstBonded, ENM::DistanceCutoff, ENM::DistanceWeight, ENM::ElasticNetworkModel, ENM::ExponentialDistance, ENM::HCA, ENM::SpringFunction, ENM::SuperBlock
• setProperty() : loos::Atom
• setSize() : loos::Math::ColMajor, loos::Math::RowMajor, loos::Math::Triangular
• setStream() : loos::StreamWrapper
• setSubset() : loos.pyloos.trajectories.Trajectory, loos.pyloos.trajectories.VirtualTrajectory
• setSuitenessCutoff() : loos::RnaSuite
• setTrigger() : loos::ProgressCounter< Trigger, Counter >
• sharedPeriodicBox() : loos::AtomicGroup
• showCharge() : loos::PDB
• showHelp() : loos::OptionsFramework::AggregateOptions
• size() : loos::MultiTrajectory, loos::UniqueStrings, loos::Weights
• skip() : loos.pyloos.trajectories.Trajectory, loos.pyloos.trajectories.VirtualTrajectory
• solve() : ENM::ANM, ENM::ElasticNetworkModel, ENM::VSA
• sort() : loos::AtomicGroup
• sorted() : loos::AtomicGroup
• sphericalVariance() : loos::AtomicGroup
• splitByMolecule() : loos::AtomicGroup
• splitByName() : loos::AtomicGroup
• splitByResidue() : loos::AtomicGroup
• splitByUniqueSegid() : loos::AtomicGroup
• stacking() : loos::AtomicGroup
• start() : loos::SimpleCounter, loos::Timer< TimerType >
• stdev() : loos::TimeSeries< T >
• stepsPerFrame() : loos::XTCWriter
• sterr() : loos::TimeSeries< T >
• stop() : loos::Timer< TimerType >
• stream() : loos::LineReader
• StreamWrapper() : loos::StreamWrapper
• strict() : loos::PDB
• stride() : loos.pyloos.trajectories.Trajectory, loos.pyloos.trajectories.VirtualTrajectory
• strings() : loos::UniqueStrings
• subset() : loos::AtomicGroup
• SuperBlock() : ENM::SuperBlock
• SuperBlockDecorator() : ENM::SuperBlockDecorator
• superposition() : loos::AtomicGroup